Morfologi Koloni

Bakteri tumbuh sangat cepat bila diberi nutrisi yang berlimpah. Berbagai jenis bakteri akan memunculkan koloni yang berbeda,  ada beberapa koloni berwarna, ada yang berbentuk lingkaran teratur, dan ada yang tidak teratur. Ciri-ciri koloni (bentuk, ukuran, pigmentasi, dll) disebut morfologi koloni. Morfologi Colony adalah cara para ilmuwan dapat mengidentifikasi bakteri.   Buku Bergey's Manual  (umumnya disebut Bergey's Manual)   menggambarkan mayoritas spesies bakteri yang diidentifikasi oleh para ilmuwan sejauh ini. Panduan ini menyediakan deskripsi untuk morfologi koloni dari setiap spesies bakteri.

Meskipun koloni bakteri dan jamur  memiliki banyak karakteristik dan   ada beberapa elemen dasar yang dapat Anda  identifikasi   

Form  - Apakah bentuk dasar dari koloni? Sebagai contoh, lingkaran, berserabut, dll
Elevation - Apakah bentuk penampang koloni? 
Margin - Apakah bentuk   tepi koloni?
Permukaan - Bagaimana permukaan koloni itu muncul? Sebagai contoh, halus, berkilau, kasar, kusam (kebalikan dari berkilauan), berkerut (keriput), dll
Kelengkapan - Sebagai contoh, transparan (jelas), buram (visi hampir jelas, melainkan juga terdistorsi, seperti melihat melalui kaca buram), tembus, warni (warna perubahan cahaya yang dipantulkan), dll
Chromogenesis (pigmentasi) - Misalnya, putih, buff, merah, ungu, dll


Harap dicatat bahwa 3 elemen tambahan morfologi harus diperiksa hanya dalam ruang isolasi di laboratorium :

konsistensi, emulsifiability, dan bau.

Lihat diagram di bawah ini untuk contoh ilustrasi bentuk, elevasi, dan margin: 

Apa yang Bisa Tumbuh di Lempeng Agar Nutrient?

- Bakteri: Setiap koloni melingkar yang berbeda mewakili suatu sel bakteri individu atau kelompok yang telah dibagi berulang kali.   sel-sel yang tumbuh membentuk sebuah koloni. Kebanyakan koloni bakteri tampak putih, krem, atau kuning dalam warna, dan melingkar teratur   .

Sebagai contoh:

Bacillus subtilis (3)


Proteus vulgaris (4)


Staphylococcus aureus


Streptococcus pyogenes (6)


- Ragi:   koloni umumnya terlihat mirip dengan koloni bakteri. Beberapa spesies, seperti Candida, dapat tumbuh sebagai tambalan putih dengan permukaan glossy.

Sebagai contoh:

Candida albicans) adalah jenis ragi yang dapat tumbuh di permukaan kulit 


koloni ragi Bulat
 
 
Koloni  ragi Pink


- Mold:   sebenarnya adalah jamur, dan mereka sering muncul abu-abu keputihan, dengan tepi fuzzy. Mereka biasanya berubah menjadi warna yang berbeda, dari tengah ke arah luar. Dua contoh jamur adalah sebagai berikut:

  Mold Hijau(Trichoderma harzianum) 


   Mold Hitam(Aspergillus nidulaus) 

Listeria dan listeriosis

Listeria dan listeriosis

PENDAHULUAN

Listeria monocytogenes telah dikenal sebagai patogen selama lebih dari enam puluh tahun. Namun, baru diidentifikasi sebagai patogen bawaan makanan setelah tahun 1980 sehubungan munculnya  wabah   listeriosis (2,6).

L. monocytogenes tersebar luas di alam, yang umumnya ditemukan di produk-produk makanan alami dan lingkungan pemrosesan makanan sebagai biofilm yang memiliki kapasitas untuk berkembang biak pada suhu pendinginan (4). Organisme ini telah diisolasi dari tanah, silase, vegetasi, sampel feses, air,  limbah domestik dan industri (3). Manusia, hewan dan lingkungan adalah habitat alami bagi organisme ini. Listeria telah diisolasi dari berbagai hewan: lebih dari empat puluh spesies mamalia dan minimal 17 jenis burung yang berbeda, termasuk ayam dan kalkun domestik (1).

Banyak makanan terkait dalam wabah listeriosis seperti susu mentah dan pasteurisasi, keju, produk daging mentah dan matang dari binatang yang berbeda, sayuran, ikan dan produk makanan siap  makan   (6). Kontaminasi pada ayam beku dalam pendingin lebih tinggi dibandingkan dengan makanan lain (5). Menurut Uboldi Eiroa (7) dan Uyttendaele et al. (8),  adalah mengkhawatirkan dan meningkatkan risiko kontaminasi silang selama persiapan antara makanan mentah dan yang sudah dimasak  . Oleh karena itu penting untuk merancang program kualitas kontrol yang baik untuk bakteri ini pada produk  pengolahan ayam. dan menekankan perlunya untuk mengembangkan metode yang efektif untuk deteksi dan identifikasi L. monocytogenes. Khususnya, untuk mengembangkan metode yang sensitif dan cepat.

Listeriosis dapat mengancam kehidupan,  sangat berisiko untuk ibu hamil, bayi baru lahir, orang tua, dan orang dengan gannguan kekebalan   (HIV, kanker). Gejala listeriosis antara lain  demam, nyeri otot, dan kadang-kadang mual serta diare. Jika infeksi menyebar ke sistem saraf,   dapat terjadi meningitis.

 

Listeria monocytogenes            Gram stain

 Apa itu Listeria?

Listeria adalah sekelompok bakteri yang ditemukan secara luas di alam misalnya di tanah, air dan usus hewan domestik maupun liar, ikan dan burung. Listeria dapat bertahan untuk jangka waktu yang lama dalam tanah, serasah daun, limbah, silase, vegetasi dan air  Listeria juga. sering ditemukan dalam lingkungan pengolahan makanan dan memiliki kemampuan untuk membentuk biofilm dan bertahan pada permukaan yang terlihat licin.

Ada enam spesies Listeria, yaitu : L. monocytogenes, L. ivanovii, L. seeligeri, L. innocua, L. welshimeri, dan L. grayi. namun Listeria monocytogenes atau L. monocytogenes adalah spesies yang paling umum yang dapat menyebabkan penyakit pada manusia dan hewan. Pada manusia, L. monocytogenes adalah agen penyebab listeriosis, berpotensi fatal pada orang berpenyakit risiko tinggi. Meskipun angka kejadian listeriosis relatif rendah, namun infeksi ini memiliki angka  fatalitas yang tinggi  . Makan makanan yang terkontaminasi adalah yang paling umum terkena penyakit ini. 

L. monocytogenes, salah satu pathogen yang dijumpai dalam produk susu

Meskipun listeria sangat jarang, beberapa kematian akibat listeriosis pernah dicatat

Patogenesis

Komplikasi infeksi Listeria termasuk: meningitis, sepsis, keguguran atau kematian janin   dan keguguran ,  pneumonia,  shock, endokarditis, pembentukan abses, dan radang mata

Patogen ini berkembang biak pada suhu rendah dan  tahan suhu pendinginan.    gejala infeksi mungkin muncul dalam 11-70 hari setelah minum atau makan makanan yang terkontaminasi  .  Bakteri ini juga dapat ditemukan dan menyebar melalui tanah.

Listeria monocytogenes masuk ke dalam sel-permukaan dan mensekresi protein yang memungkinkan keterikatan pada sel inang, meloloskan diri dari vakuola fagositosis dan   menyerang sel. Internalin A (InlA) dan memediasi InlB.   L. monocytogenes menuju ke permukaan sel inang, dan listeriolysin O (llo) melisiskan membran phagosomal. Protein aktin (Acta) merangsang dan mengkatalisis polimerisasi aktin,  mendorong bakteri keluar sel dan memasuki sel-sel yang berdekatan. L. monocytogenes memproduksi fosfolipase fosfatidilkholon PlcB, seng metaloproteinase (MPL) dan llo, untuk meloloskan diri dari vakuola sekunder dan menyerang sel yang baru. 

Apa saja gejalanya?

Mayoritas kasus listeriosis begitu ringan bahwa mereka dianggap hanya infeksi virus ringan atau flu.   Gejala umum lainnya adalah diare, mual dan kram perut.

Penyakit ini dapat berkembang menjadi bentuk yang lebih serius, seperti septikemia, meningitis (atau meningoencephalitis) dan ensefalitis Pada wanita hamil,. listeriosis dapat menyebabkan infeksi intrauterine atau leher rahim, yang dapat mengakibatkan aborsi spontan atau keguguran. 

Awal gejala sering ringan dan mungkin tidak ada sampai beberapa hari sampai minggu setelah infeksi terjadi, penderita mungkin tidak sadar mereka telah terinfeksi dan tidak mungkin mencari bantuan medis.  

Siapa yang berisiko?

Infeksi Listeria biasanya tidak mempengaruhi orang dewasa yang sehat dan anak-anak. Namun, bisa sangat serius bagi wanita hamil dan anak-anak mereka yang belum lahir, bayi yang baru lahir, orang tua dan orang-orang yang sistem kekebalan tubuh telah dilemahkan oleh penyakit atau sakit, seperti yang menderita kanker , leukemia, AIDS, diabetes, hati atau penyakit ginjal dan siapapun pada obat yang dapat menekan sistem kekebalan (misalnya, kortikosteroid seperti prednisone atau kortison - tetapi tidak krim topikal   dan salep), termasuk pasien transplantasi organ.

Perbedaan dalam kerentanan ada di antara berbagai sub-populasi misalnya pasien transplantasi organ   dianggap lebih rentan terhadap listeriosis daripada lain pada sub-populasi berisiko (lihat Gambar 1).

Gambar 1: susceptibility Relatif  untuk immunocompromised dan non-immun 

Risiko   listeriosis meningkat dengan bertambahnya usia bahkan tanpa adanya suatu penyakit yang mendasari  Di Australia,. Usia rata-rata infeksi non-kehamilan  68 tahun. Oleh karena itu orang yang lebih tua dari 65-70 tahun perlu mempertimbangkan untuk mengambil tindakan pencegahan terhadap listeriosis. 

Seberapa sering listeriosis?

Listeriosis adalah penyakit langka.  Laporan tentang kejadian penyakit ini jauh lebih rendah dibandingkan penyakit bawaan makanan lainnya, namun konsekuensi dari infeksinya yang parah. Di Australia ada sekitar 60 kasus listeriosis dilaporkan kepada otoritas kesehatan setiap tahunnya Mayoritas  listeriosis  pada pasien lanjut usia atau orang yang telah tertekan sistem kekebalan tubuhnya.

Kebanyakan kasus listeriosis  adalah sporadic, sumber dan rute infeksi biasanya tidak diketahui, namun, makanan yang terkontaminasi dianggap rute utama penularan. periode inkubasi berkisar dari beberapa hari sampai tiga bulan.

Sejumlah kecil infeksi (kurang dari 10 per tahun) terjadi pada wanita hamil dan anak yang belum lahir. Namun, kejadian yang sebenarnya infeksi tersebut sering tidak diselidiki atau didiagnosis. Pengujian tidak rutin dilakukan pada kasus keguguran janin  .

Seberapa berbahayakah listeriosis?

Ada bukti yang menunjukkan bahwa Listeria adalah flora saluran usus pada manusia,   2-10% dari populasi umum adalah pembawa organisme tanpa gangguan kesehatan. Dalam populasi rentan bakteri  ini  paling sering mempengaruhi aliran darah, sistem saraf pusat atau uterus  

Manifestasi listeriosis termasuk bakteremia / septikemia, meningitis, meningoencephalitis, ensefalitis, keguguran, lahir mati, kelahiran prematur, penyakit neonatal dan penyakit prodromal pada wanita hamil. Listeriosis memiliki tingkat kematian yang tinggi sampai dengan 50% untuk infeksi ibu-janin dan sekitar 20% untuk infeksi non-kehamilan.

Bagaimana Listeria masuk ke dalam makanan?

Listeria tersebar luas di lingkungan dan mungkin mengkontaminasi makanan siap saji  atau   beberapa saat setelah pemrosesan,  kemudian tahap antara pabrik pengolahan dan piring konsumen. Kontaminasi juga dapat terjadi melalui kebersihan penjamah makanan yang kurang, atau terjadinya kontaminasi silang   dengan makanan mentah atau permukaan yang terkontaminasi.

Tidak seperti bakteri penyebab keracunan makanan, Listeria tumbuh perlahan-lahan bahkan pada suhu pendingin.   Listeria akan tumbuh lebih cepat pada temperatur yang lebih tinggi, sehingga makanan yang telah disimpan untuk waktu yang lama dan / atau yang belum disimpan dalam pendingin dapat menimbulkan risiko yang lebih tinggi pada orang yang rentan .

Listeria mungkin ada dalam beberapa jenis makanan seperti makanan mentah sebelum diolah atau makanan matang  yang telah disimpan selama beberapa waktu.

Tindakan pencegahan apa yang harus diambil jika saya 'beresiko'?

Makanan yang paling sering dikaitkan dengan listeriosis adalah makanan siap saji yang disimpan terlalu lama dalam pendingin, ini mendukung pertumbuhan Listeria,  dan dikonsumsi tanpa perlakuan listericidal  lebih lanjut  seperti reheating sampai 74 ° C selama 2 menit.

Makanan kemasan (yaitu dalam bungkus atau wadah oleh produsen)   biasanya tidak terdapat risiko   sebagaimana makanan unpackaged atau makanan terbuka di sebuah toko makanan, sandwich bar atau salad bar, dll Ini adalah karena makanan unpackaged lebih cenderung menjadi terkontaminasi oleh Listeria ..

Untuk orang yang berisiko tertular listeriosis, disarankan untuk makan makanan yang baru dimasak atau baru disiapkan. Makanan baru dimasak aman karena memasak menghancurkan bakteri Listeria Juga,. Peluang kontaminasi oleh Listeria diminimalkan  sebelum makanan dikonsumsi. Makanan harus dimasak dengan suhu  minimum 74 ° C untuk menghancurkan bakteri Listeria.

  Makanan seperti salad buah, salad hijau dan masakan sayuran harus segera dimakan segera setelah disiapkan secara higienis. Menyimpan makanan di chiller tidak tidak mencegah pertumbuhan karena Listeria akan tumbuh pada suhu pendinginan Cobalah untuk menghindari makanan yang disimpan. untuk menghindari kontaminasi. Bila memungkinkan, hanya menyiapkan makanan yang cukup untuk sekali makan.  

Memilih makanan yang lebih aman

Pengendalian Listeria dalam bisnis makanan sebagian besar dikelola dengan pengolahan higienis, persiapan, penyimpanan dan penanganan makanan. Namun demikian ada juga makanan risiko  tinggi, dan  konsumen harus menghindari makanan ini, terutama jika terdapat ketidakpastian bahwa praktek-praktek higienis telah dijalankan.   Daftar tabel berikut adalah Contoh makanan risiko tinggi dan makanan alternatif yang lebih aman.   Makanan risiko   tinggi menjadi aman untuk dikonsumsi jika mereka dimasak atau dipanaskan dengan uap panas   dan disajikan dalam keadaan panas.

CONTOH BEBERAPA MAKANAN RISIKO TINGGI

 

ALTERNATIVES supaya AMAN bila dikonsumsi

Identifikasi Listeria monocytogenes

Genus Listeria terdiri dari 6 spesies: L. monocytogenes, L. ivanovii, L. seeligeri, L. innocua, L. welshimeri, dan L. grayi.

Dikenal serotipe L. monocytogenes adalah: 1/2a, 1/2b, 1/2c, 3a, 3b, 3c, 4a, 4b, 4c, dan 4d. Serotyping dilakukan dengan bantuan antiserum komersial (Denka Seiken).

Metode ALOA

ALOA ® (protokol ALOAOneDay, ® dan ALOACount ®  ). telah menjadi media wajib protokol ISO (EN ISO 11290-1 dan ISO 11290-2) untuk skrining dan enumerasi  L. monocytogenes.

ALOA, diproduksi oleh AES CHEMUNEX sejak tahun 1997, adalah media  berkromogen untuk deteksi Listeria monocytogenes./ Metode ini diciptakan untuk memenuhi standar  EN ISO 11290

Hasil  sampel negatif diketahui setelah inkubasi 24 jam pada ALOA ®

Listeria tumbuh sebagai koloni biru-hijau, tepi teratur (deteksi β-glukosidase dengan menggunakan substrat berkromogen tertentu).

Listeria monocytogenes juga menunjukkan halo opak, ini membantu untuk dengan mudah membedakan mereka dari spesies Listeria lainnya.

Halo ini disebabkan adanya aktivitas   fosfolipase terkait dalam proses infeksi Listeria patogen.

Tahapan Uji

Skrining Test

ALOA oneday ®

Enumerasi

ALOA Count ®

Konfirmasi

ALOA Confirmation®

 ALOA Confirmation® adalah metode konfirmasi Listeria monocytogenes setelah deteksi dengan ALOA oneday ® atau enumerasi dengan ALOA Count ®

- Konfirmasi dari sebuah koloni  tunggal  yang khas

- Inokulasi dengan garis/streak tunggal

- Sampai dengan 6 konfirmasi per plate

- Hasil dalam waktu 24 jam saja

Setiap sampel positif yang terdeteksi oleh   metode   ALOA oneday, kemudian dikonfirmasikan dengan   ALOA Confirmation tidak memerlukan penyelidikan lebih lanjut.

Media isolasi lain:

CHROMagar

Media Listeria CHROMagar berkromogen untuk isolasi specimen didasarkan pada phospholipases spesifik Listeria monocytogenes., memungkinkan pembedaan langsung Listeria monocytogenes berdasar warna koloni biru dengan lingkaran putih di sekitar koloni, dibaca di bawah pencahayaan normal,  sedangkan  spesies bakteri lainnya dihambat atau memberikan warna biru tanpa halo atau warna koloninya  seperti media biakan  CHROMagar,  sehingga koloni Listeria monocytogenes   mudah dideteksi dan dapat dipelajari secara langsung dengan tes aditional untuk konfirmasi dan tindak lanjut epidemiological 

Dengan media kaldu Faser 1 / 2 diperkaya    inkubasi selama  48 jam pada 37 º C kemudian streak ke  media  Listeria CHROMagar  plate dan inkubasi  selama 24 jam pada suhu 37 º C.

Hasil.

Listeria monocytogenes - biru dengan lingkaran putih

koloni bakteri lain - Dihambat, biru tanpa halo atau tidak berwarna

COMPASS Listeria Agar

Media COMPASS Listeria Agar adalah media selektif yang digunakan untuk isolasi, diferensiasi dan penghitungan Listeria monocytogenes dalam produk makanan, sampel lingkungan, dan sampel patologis.   Formulasi sesuai dengan yang diatur dalam protokol deteksi dan penghitungan sesuai  standar EN ISO 11290-1 dan 11290-2  .

COMPASS Listeria Agar juga digunakan sebagai metode alternatif deteksi cepat L. monocytogenes dalam produk makanan manusia dan sampel lingkungan tanpa tahap preenrichment terlebih dulu,         secara resmi disertifikasi oleh AFNOR     

Pertumbuhan koloni L.monocytogenes pada media COMPASS Listeria Agar

Dalam rangka memantau kerentanan antibiotik dari strain terisolasi,  perlu dilakukan uji resistensi antibiotika untuk mengetahui nilai MIC  terhadap 10 antibiotika: ampisilin, amoksisilin, kloramfenikol, siprofloksasin, eritromisin, gentamisin, streptomisin, tetrasiklin, trimetoprim / sulfametoksazol, vankomisin. Nilai MIC  ditentukan untuk semua strain klinis dengan cara Etest (AB-Biodisk).

                                                                                                                                    

   REFERENCES

1. Donnelly, C.; Brackett, R.E.; Doores, S. Listeria. In Vanderzant, C., Splittstoesser, D.F. (eds.), Compendium of methods for the microbiological examination of foods, 3. Ed. American Public Health Association Washington, 1992, pp.637-663.          

2. Lovett, J. Listeria monocytogenes. In Doyle, M.P. (ed), Foodborne Bacterial Pathogens. Marcel Dekker Inc., N.Y., 1989

3. McGlaughlin, J. Listeria monocytogenes, recent advances in the taxonomy and epidemiology of listeriosis in humans. J. Appl. Bacteriol., 63:1-11, 1987.         

4. Muriama, P.M. Bacteriocins for control of Listeria spp. in food. J. Food Prot., 59:54-63, 1996.          

5. Pini, P.N.; Gilbert, R.J. The occurence in the U.K. of Listeria species in raw chickens and soft cheeses. Int. J. Food Prot., 56(7):616-618, 1993.          

6. Ryser, E.T.; Marth, E.H. Listeria, Listeriosis, and Food Safety. University of Wisconsin, New York, 1991, 632p.          

7. Uboldi-Eiroa, M.N. Listeria monocytogenes – Características, ocorrência e desenvolvimento em alimentos. Col. Inst.Tec. Alim., Campinas. 20(1):13-22, 1990.         

8. Uyttendale, M.R.; Neyts. K.D.; Lips, R.M.; Debevere, J.M. Incidence of Listeria monocytogenes in poultry and poultry products obtained from Belgian and French abbatoirs. Food Microb. 14(4):339-345, 1997.          

 WEB :

         http://www.m-techdiagnostics.ltd.uk

         http://www.solabia.fr/solabia/produitsDiagnostic.nsf         

         http://www.nature.com/

         www.aloa-listeria.com

         http://bacterio.iph.fgov.be

         http://www.foodstandards.gov.au

 

Sampel untuk Mikrobiologi

Pengumpulan dan Pengolahan Sampel   untuk Mikrobiologi

Keberhasilan diagnosis mikrobiologi tergantung pada banyak faktor, antara lain: pengumpulan dan transportasi sampel yang representative.     Bagian ini menjelaskan tentang koleksi sampel/spesimen, pemrosesan, dan rekomendasi khusus untuk setiap jenis spesimen.

Salah satu aturan  paling penting dalam pengambilan spesimen adalah  mengumpulkan sampel dari situs anatomi yang benar,   contoh  lesi dangkal tidak berguna dalam mengidentifikasi penyebab infeksi luka dalam. Waktu pengambilan sampel juga penting, misalnya sampel harus dikumpulkan sebelum pemberian antibiotik.

Secara umum, selain spesimen tinja,    teknik   dan peralatan steril harus diterapkan.   Potongan jaringan atau bahan sebaiknya disedot daripada  diusap.     Volume spesimen yang dikumpulkan harus mencukupi, sesuai jumlah tes yang diminta.  Spesimen harus ditempatkan dalam wadah anti bocor dan berlabel. Penggunaan kontainer jenis tertentu, berisi media khusus atau pengawet mungkin diperlukan. Wadah kemudian ditempatkan dalam kantung Biohazard untuk transportasi ke laboratorium. Setiap spesimen harus disertai dengan blangko permintaan   yang berisi semua informasi yang diperlukan untuk mengevaluasi specimen,  yang memuat nama pasien, usia, jenis kelamin, nomor identifikasi, lokasi, nama dokter, waktu dan tanggal koleksi, jenis spesimen, diagnosis, dan uji yang diminta. 

Transportasi spesimen ke laboratorium harus cepat, secara optimal dalam waktu kurang dari 2 jam. Untuk keterlambatan transportasi, spesimen harus didinginkan; kecuali darah, cerebrospinal fluid (CSF), dan spesimen yang  diperiksa untuk anaerob, organisme yang rewel seperti Neisseria gonorrhoeae danBordetella pertussis, serta Trichomonas vaginalis, yang semuanya harus dipertahankan pada suhu ruang.

Setibanya di laboratorium, spesimen dan blangko permintaan diperiksa untuk memastikan bahwa semua kriteria terpenuhi. kriteria minimum untuk spesimen yang bias diterima   tercantum dalam Tabel  1.  Selain itu, beberapa spesimen mungkin tidak diterima untuk prosedur mikrobiologi tertentu. Sebagai contoh, beberapa spesimen tidak dapat diterima untuk biakan anaerob (Tabel  .2) karena flora normal anaerob yang terkandung dalam spesimen akan menyulitkan untuk membedakan patogen dari nonpathogen.    Jika informasi tentang permintaan tidak lengkap, petugas laboratorium harus meminta orang yang bertanggung jawab untuk memberikan informasi sebelum memproses spesimen lebih lanjut. 

TABEL  1. CONTOH KRITERIA PENOLAKAN

Suhu Transportasi yang tidak tepat   Kontainer   atau media transport yang tidak tepat Waktu transportasi yang lama Spesimen Tidak berlabel    Kontainer Pecah atau retak   Spesimen Bocor Specimen kering Spesimen yang tidak tepat untuk uji diminta Volume yang tidak memadai Spesimen di fiksatif (untuk kultur) Sampel lebih 24-jam (untuk biakan urin, dahak   kotoran)

TABEL .2. SPESIMEN YANG TIDAK UMUM UNTUK BIAKAN  ANAEROBIK

Swab Tenggorokan, nasofaring, atau gingiva   Sputum Cuci atau sikat Bronkial  , lavage,   (kecuali jika diambil dengan kateter lumen ganda tertutup) Kuras lambung dan usus Ileostomy dan kolostomi efluen Urin Voided atau catheterized   spesimen saluran kelamin melalui vagina   usapan Permukaan ulkus, luka, dan abses

Semua spesimen harus dianggap mengandung agen menular dan karenanya harus dikumpulkan dan ditangani dengan menggunakan tindakan pencegahan standar. kewaspadaan standar adalah setara dengan kewaspadaan universal yang dirancang untuk mengurangi resiko penularan mikroorganisme. Ini termasuk penggunaan sarung tangan, jas lab, masker, dan kacamata pelindung.    Spesimen   untuk mendeteksi mikobakteri atau jamur harus dilakukan dalam kabinet biologis kelas II.

Banyak spesimen  untuk deteksi bakteri diuji secara langsung menggunakan pewarnaan Gram, dan Pewarnaan Tahan Asam jika   dicurigai mikobakteri (BTA).  Beberapa spesimen   untuk mendeteksi jamur   diperiksa secara langsung dengan kalium hidroksida (KOH) dan / atau Calcofluor

  Spesimen tinja dapat langsung diperiksa untuk parasit dengan metode preparat basah   tetapi lebih sering ditempatkan dalam fiksatif dan diperiksa setelah prosedur konsentrasi. Teknik  untuk pemeriksaan spesimen langsung lainnya, seperti Direct   fluorescent antibody (DFA), enzim immunoassay (AMDAL), dan hibridisasi DNA atau tes amplifikasi digunakan hanya dalam situasi khusus.

  Jenis media yang digunakan untuk mengisolasi bakteri dan jamur,  antara lain media diperkaya, nonselektif, selektif, atau media diferensial. Virus adalah parasit intraseluler obligat dan hanya dapat dibiakkan dalam sel mamalia, yang ada tiga kategori utama:  primary, low-passage finite, and continuous cell lines.   Dengan sedikit pengecualian, biakan parasit umumnya tidak dilakukan.

Kebanyakan biakan  bakteri diinkubasi selama 2 sampai 3 hari. Mikobakteri dan kultur jamur diinkubasi selama 6 minggu,   kultur sel diinkubasi dengan  panjang waktu tergantung pada sumber spesimen dan laju pertumbuhan virus   (Tabel  .3).       Teknik cepat yang digunakan untuk membiakkan beberapa virus memerlukan 24-72 jam inkubasi. Suhu inkubasi biasanya 35 ° C untuk bakteri dan virus serta 30 ° C untuk jamur. Berbagai kondisi atmosfer yang digunakan antara lain ambien, penambahan CO2  , mikroaerofil, dan anaerobik.

TABEL .3. Waktu  PERTUMBUHAN Viral

Virus Pertumbuhan (hari) Adenovirus         2-10 Sitomegalovirus 5-28 Enterovirus 2-8 Herpes simpleks 1-7 Influenzavirus 2-10 Penyakit gondok 5-10 Parainfluenza 4-10 Respiratory syncytial virus 3-10 Rhinovirus 4-10 Varicella-zoster 5-28 Diadaptasi dari Forbes BA, San DF, Weissfeld AS, eds. Bailey dan Scott diagnostik mikrobiologi, 10th ed.St Louis, Mosby, 1998.

•  

JENIS SPESIMEN MIKROBIOLOGI

• DARAH
• Cerebrospinal FLUIDA
• EAR
• EYE
• Saluran pencernaan
• Saluran genital
•   SALURAN PERNAPASAN BAWAH
•   SALURAN PERNAPASAN ATAS
• JARINGAN
• URINE
• KULIT DAN lesi subkutan